Azure HPC 缓存数据引入 - 并行复制脚本方法

  • 项目

本文说明了如何创建 parallelcp 脚本并使用它将数据移到 Blob 存储容器，以便在 Azure HPC 缓存中使用。

若要详细了解如何将数据移到 Azure HPC 缓存的 Blob 存储，请阅读将数据移到 Azure Blob 存储。

创建 parallelcp 脚本

以下脚本将添加可执行文件 parallelcp。 （此脚本适用于 Ubuntu；如果使用其他分发版，则必须单独安装 parallel。）

sudo touch /usr/bin/parallelcp && sudo chmod 755 /usr/bin/parallelcp && sudo sh -c "/bin/cat >/usr/bin/parallelcp" <<EOM
#!/bin/bash

display_usage() {
    echo -e "\nUsage: \$0 SOURCE_DIR DEST_DIR\n"
}

if [  \$# -le 1 ] ; then
    display_usage
    exit 1
fi

if [[ ( \$# == "--help") ||  \$# == "-h" ]] ; then
    display_usage
    exit 0
fi

SOURCE_DIR="\$1"
DEST_DIR="\$2"

if [ ! -d "\$SOURCE_DIR" ] ; then
    echo "Source directory \$SOURCE_DIR does not exist, or is not a directory"
    display_usage
    exit 2
fi

if [ ! -d "\$DEST_DIR" ] && ! mkdir -p \$DEST_DIR ; then
    echo "Destination directory \$DEST_DIR does not exist, or is not a directory"
    display_usage
    exit 2
fi

if [ ! -w "\$DEST_DIR" ] ; then
    echo "Destination directory \$DEST_DIR is not writeable, or is not a directory"
    display_usage
    exit 3
fi

if ! which parallel > /dev/null ; then
    sudo apt-get update && sudo apt install -y parallel
fi

DIRJOBS=225
JOBS=225
find \$SOURCE_DIR -mindepth 1 -type d -print0 | sed -z "s/\$SOURCE_DIR\///" | parallel --will-cite -j\$DIRJOBS -0 "mkdir -p \$DEST_DIR/{}"
find \$SOURCE_DIR -mindepth 1 ! -type d -print0 | sed -z "s/\$SOURCE_DIR\///" | parallel --will-cite -j\$JOBS -0 "cp -P \$SOURCE_DIR/{} \$DEST_DIR/{}"
EOM

并行复制示例

本例使用并行复制脚本利用 Azure HPC 缓存中的源文件编译 glibc。

源文件将缓存在 Azure HPC 缓存装入点中，而对象文件将存储在本地硬盘上。

本示例将并行复制脚本与选项 -j 和 make 配合使用，以实现并行化。

sudo apt-get update
sudo apt install -y gcc bison gcc binutils make parallel
cd
wget https://mirrors.kernel.org/gnu/libc/glibc-2.27.tar.bz2
tar jxf glibc-2.27.tar.bz2
ln -s /nfs/cache1 hpccache
time parallelcp glibc-2.27 avere/glibc-2.27
cd
mkdir obj
mkdir usr
cd obj
/home/azureuser/avere/glibc-2.27/configure --prefix=/home/azureuser/usr
time make -j